Atliekant techninio, eksploatacinio arba organizacinio pobūdžio geležinkelių sistemos pakeitimus, turi būti taikomas pavojaus valdymo procesas pagal 2013 m. balandžio 30 d. Komisijos įgyvendinimo reglamentą (ES) Nr. 402/2013, kuriuo nustatomas bendrasis saugos būdas, susijęs su pavojaus nustatymu ir pavojaus vertinimu, ir panaikinamas Reglamentas (EB) Nr. 352/2009.
Vertinami tik tie organizacinio pobūdžio pakeitimai, kurie gali daryti poveikį eksploatavimo ar techninės priežiūros procesui.